Аниме рассказывает о японском гончаре, похищенном китайской мафией, которая заставила его работать наёмным убийцей. Прозвище «Crying Freeman» («плачущий убийца») он получил из-за привычки оплакивать своих жертв. После того, как Эму Хино увидела его (Фримена), убивающего босса якудзы, она сама стала следующей в списке у Йо. Но между жертвой и убийцей возникло непреодолимое влечение. Вместе они решают преодолеть все препятствия, которые создаст на их пути жизнь. Но мафия, и полиция охотятся за Йо, так что им будет очень нелегко осуществить свои мечты...