В 1637 году сёгунат Токугава вводит строгие религиозные ограничения. Христианское население Японии, компактно проживающее в нескольких провинциях, подвергается жестоким гонениям. Власти облагают их непомерными налогами, обрекая на голодную смерть. Недовольных подвергают пыткам и мучительной казни. Не выдержав произвола и насилия, крестьяне поднимают восстание. Во главе его становится молодой самурай Амакуса Сиро, взявший себе христианское имя Джером (Иероним). Люди говорили, что к нему прилетают и садятся на руку птицы, что он может ходить по воде и извергать изо рта огонь. Сиро тайно помогает его друг Синбэй, находящийся на службе у князя в замка Симабара. Ни одна из сторон не знает жалости к врагу.